[trunk] Sync with 1.5 branch

[trunk] Backout r1513 for now.

[trunk] merge rev 1330/1331 from branch 1.5 onto trunk

[trunk] merge rev 1333 from 1.5 to trunk

[trunk] merge rev 1228 from 1.5 to trunk

[trunk] Import change from 1.5 branch over to trunk

[trunk] Synchronize with 1.5 branch, installation convention

[trunk] minor coding style change to match 1.5

[trunk] Import getopt modification from 1.5 branch

[trunk] Import remaning bits from JPIP/1.5 over to trunk

[trunk] Merge rev 1068 into trunk

[trunk] Remove junk from merge

[trunk] Import rev 1103 into trunk.

[trunk] correct bug when we expand the list of marker in a tile

[trunk] check the PSot value during the reading of SOT marker

[trunk] do not distribute binary in the source code. Remove *.jar files

[trunk] import JPIP modifications for build-system from 1.5

[trunk] Import applications modifications from 1.5 over to trunk

[trunk] Convert from DOS eol to UNIX eol

[trunk] Backport from OPJViewer version 1.5 over to trunk

[trunk] Remove left-over Makefile

[trunk] Sync OPJViewer with 1.5 version

[trunk] Backport toplevel files from 1.5

[trunk] Remove copyrighted material from java-jni. Import patch from 1.5 over to trunk/JavaOpenJPEG

[trunk] Backport toplevel changes from 1.5 over to trunk. Remove hand-generated CHANGES file

[trunk] Merge the CMake/ dir from opj 1.5

Integrate some more diffs from the 1.5 branch

Start merging of the 1.5 branch into trunk. Start with doc

add opj_logo.icns for trunk and 1.5

Fix test NR-ENC-Bretagne2.ppm-4-encode on linux.

Fix strange line, as reported by lockalsash (gmail.com)

minor typo

[trunk] remove some warnings detected by cppcheck

Add new mechanism for cppcheck

Update changelog

Apply patch from Brad Hards to fix some typos.

Apply doxygen fixes suggested by Brad Hards on opj mailing list.

Sorry. Reverting mistake.

Simplify code. Use standard find_package call instead. ctest script will need to handle this now

Add CPack stuff

[trunk] fix a bug during the creation of the codestream index

[trunk] fix warnings when printing large integers

[trunk] fix a warning about a recent commit (1104)

[trunk] fix compilation of j2k_random_access on Visual C++

[trunk] make large file support variables persistent in CMake to allow reconfiguration

[trunk] fix call to opj_destroy_cstr_info_v2 in j2k_random_tile_access

[trunk] fix bug during random access to tile (tile already decoded)

[trunk] fix error about the way to detect the additional test suite

[trunk] implement Large File support in the library

[trunk] fix error with new way to detect kdu_expand

[trunk] add support for Large File in autoconf

[trunk] fix definition of _FILE_OFFSET_BITS macro on platform where it is needed

[trunk] add definitions for 64 bits integer types, and define OPJ_OFF_T to map to OPJ_INT64 systematically

[trunk] activate LargeFileSupport in CMake

[trunk] search for kdu_expand in a more cmake-compliant way

[trunk] clean up redundant includes already handled in opj_includes.h

[trunk] backout wrong changeset 1091 - see issue 123

[trunk] support seeking in files larger than 2 GB

Remove duplicate definition

Cleanup jpip cmake compilation

add note for cmake

Use cmake style define. Fix big endian issue on dual OS (eg. Tiger)

minor reindentation

Remove exe bit from source files

fix variable name to be hidden

Avoid message pollution during cmake configuration time

[trunk] WIP: fix bug with windows platform and j2k_dump

[trunk] WIP: fix bug with windows platform and j2k_to_image

[trunk] WIP: fix bug when decoding an area or a tile with special resolution

[trunk] WIP: enhance j2k_to_image with new get_decoded_tile functionality

[trunk] WIP: clean j2k_dump and enhance j2k_dump with commit 1052

[trunk] WIP: add a set decoded resolution factor function and update j2k_to_image help about decoded region

[trunk][JPIP] fixed opj_server execusion error (instant terminating) with autotool, cmake still need to be fixed

[trunk] fix tests/nonregresion/CMakeList.txt

[trunk] WIP: fix get_decoded_tile function to avoid error with output image

[trunk] fix bug with mj2 applications (credit to winfried)

[trunk] enhance mj2 when read jp2h (credit to winfried)

[trunk] check if the file extension is the same as the infile format (credit to winfried)

[trunk] add some sanity check in CMakeLists to prevent STRING(REGEX..) call issues

[trunk][JPIP] enabled OpenJPEG V2 API

[trunk] WIP: add get_decoded_tile functionality

[trunk] WIP: clean and enhance j2k files

[trunk] WIP: clean and enhance openjpeg.c

[trunk] WIP: clean and enhance openjpeg.h and add deprecated macro

[trunk][JPIP] updated main page of doxygen

solved memory leak of opj_server, and removed redundant defines

[trunk][JPIP] additional patches for autotools and cmake

additional patches for autotool are applied

fixed client viewer to be compatible with server response header both Content-type and Content-Type

patches for cmake and autotool are applied

[trunk] WIP: add a file to exclude some valgrind errors (detected with ctest_memcheck) related to png lib found with ubuntu10.04 platform

[trunk] WIP: solve problems with reading of elements outside the tilec->data buffer in dwt

[trunk] WIP: manage output image with area correponding to the set decoded area

[trunk] WIP: enhance codestream index generation

[trunk] WIP: isolate dump test suite

WIP: remove memory leak about new jp2_read_marker function

[trunk] WIP: remove previous commit about memory leak with ppm read function

[trunk] WIP: solve memory leak with ppm read function

start using API style in openJPIP library

[trunk] WIP: solve problem with writing of tga image from an image with signd=1 (credit to Winfried)